CodonCode Aligner

CodonCode Aligner é um programa para a montagem de seqüência, edição e detecção de mutações, disponível para Windows e Mac OS X. Ele é compatível com Phred-Phrap e suporta plenamente índices de qualidade de sequência, enquanto oferece uma interface familiar e fácil de aprender.

Principais features

Alinhamento de Sequências
Análise de Variantes
Visualização de Dados Genômicos
Suporte a Múltiplos Formatos de Arquivo
Integração com Ferramentas de Bioinformática

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  • Algoritmos de montagem de múltiplas sequências e alinhamento de sequências;
  • Edição de sequência manual e automatizada;
  • Alinhe os contigs entre si e retorne aos dados de rastreamento subjacentes com um simples clique duplo;
  • Sequências de referência e tabelas de diferenças;
  • Detecção sensível de mutação;
  • Métodos avançados para análise indel heterozigótica;
  • Ferramentas de automação: montagem por nome e script;
  • Clonagem de restrição, montagem Gibson, análise RFLP, design de primer;
  • CodonCode Aligner oferece muitos recursos exclusivos não encontrados em outros programas, mas é significativamente mais acessível.


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