Geneious

O Geneious é um software que mapeia sequências genéticas e alinhamento, podendo ser usado por laboratórios para fins de experimentos que incluem sequências de material genético e algoritmos de estudo.

Principais features

Análise de Sequências
Alinhamento de Sequências
Visualização de Genomas
Anotação de Genes
Construção de Filogenias

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Sem mais lutas com navegadores online confusos – a montagem de sequência e o mapeamento de referência seguem os mesmos passos. Esteja confiante que suas montagens estão usando algoritmos afinados e que você gosta de usar uma interface gráfica clara.


O exclusivo mapeador Geneious Read produz resultados superiores quando comparado com outros algoritmos de mapeamento populares e porque suas performances são realizadas dentro de um framework, todos os seus dados permanecem em um só lugar.


O Geneious é flexível o suficiente para lidar com erros de leitura, compreendendo bases incorretas ou indels curtas. Ele pode lidar com dados de qualquer tipo de máquina de sequenciamento com leituras de qualquer comprimento, incluindo leituras emparelhadas e misturas de leituras a partir de diferentes máquinas de sequenciamento.


O laboratório vai adorar o desenho de estratégias de clonagem com o Geneious. Economize tempo, dinheiro e frustração com a abrangente funcionalidade em termos de clonagem de silico. Ilustre seus modelos e vetores com anotações automáticas. O Geneious está ligado ao PlasMapper que lhe permite destacar automaticamente plasmídeos com promotores comuns, terminadores, sítios de clonagem, locais de restrição, genes repórteres, tags de afinidade, genes marcadores selecionáveis, origens de replicação e frames de leitura aberta.


Arraste e solte seus dados importantes, personalize suas listas de restrição de enzimas e exiba todas as elas em seu fragmento de DNA linear ou circular, tudo em tempo real. Enzimas comercialmente disponíveis, incluindo GoldenGate e BioBrick já estão armazenadas no Geneious.


Sem ter que lançar um novo programa você pode apenas clicar sobre o alinhamento produzido por qualquer um dos algoritmos de alinhamento do Geneious. O espectador matriz de distância interativo permite calcular rapidamente estatísticas significativas na análise filogenética. Exporte seu trabalho artístico filogenético e publique-o. Manipule as configurações de exibição para personalizar as etiquetas do ramo, etiquetas, etiquetas de extremidade, forma de árvore, escala de árvore ou colorir os clados para obter a sua árvore de maneira exata que você precisa para ele. Uma vez que sua árvore é construída salve-a em um formato de vetor de alta qualidade como svg, pdf ou eps para publicação ou impressão para que você possa colocá-lo na parede.


Requisitos do Sistema


• Windows XP
• Windows Vista
• Windows 7 e 8
• Mac OS 10.6, 10.7 e 10.8
• Linux CentOS 6, RHEL6, Ubuntu Desktop LTS


Nota: O Geneious também precisa do Java 1.6 ou superior para ser executado.

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