Primer

 Primer tem sido a ferramenta de excelência para a comunidade de pesquisa em biodiversidade marinha e cada vez mais utilizados em estudos terrestres, de água doce e paleo. Também amplamente utilizado comercialmente para a avaliação de impactos ambientais dos campos de petróleo, descartes industriais, mineração, pesca de arrasto e aquicultura.

 Os métodos de análise únicos, as suposições sobre a forma de dados (ordenação “não-métrica” e testes de permutação são fundamentais para a abordagem) se concentram em abordagens que são simples de entender e explicar.

 Os métodos estatísticos subjacentes ao software são explicados em termos não-matemáticos em um extenso ‘Manual de métodos’, que também mostra os resultados de vários estudos da literatura, por exemplo, dos efeitos ambientais de derramamentos de petróleo, perfuração de subsolos macios, esgoto e poluição, perturbação ou efeitos climáticos sobre a composições de recife de coral ou comunidades de peixes, efeitos sobre a biodiversidade mais fundamental e padrões de ecologia de comunidades, estudos mesocosmo com resultados multi-espécies, etc. Muitos desses conjuntos de dados completos estão incluídos no pacote para que o usuário pode replicar as análises contidas no manual.

 A plena integração dentro de um ambiente padrão do Windows permite:

• Fácil manipulação de dados e resultados, por exemplo, de entrada/saída a partir de planilhas Excel ou de outras fontes;
• Capacidade de visualizar e manipular dados e alguns arquivos/parcelas derivados na tela, em múltiplas janelas;
• Impressão padrão do Windows e exportação para bmp (gráficos) e arquivos rtf(de texto);
• Flexibilidade na análise, especificando, em particular para subconjuntos de dados e na definição e exibição de estruturas de grupo para os testes;
• Capacidade de lidar com grandes conjuntos de dados relativamente (sujeito a memória do Windows disponíveis e, principalmente, limitações de tempo – como acontece com todos os métodos não-paramétricos e baseados em permutação.

 Uma característica única de PRIMER 6 é a capacidade de calcular os índices de biodiversidade com base na distinção taxonômica ou parentesco das espécies que compõem uma amostra quantitativa ou lista de espécies, índices cujas propriedades estatísticas são robustas a variações no esforço de amostragem.

 Estas rotinas de análises fornecem uma possível maneira de comparar os padrões de biodiversidade com medidas mais largas de escalas de espaço e tempo, quando o esforço de amostragem não é controlado.