Descrição detalhada
RNA-Seq
Faça a quantificação de genes, exon e níveis de transcrição. Identifique novos eventos, genes expressos diferencialmente, fusões de genes e formas de junção.
DNA-Seq
Strand NGS permite a detecção de SNPs, InDels, CNVs e outros SVs. As previsões funcionais podem ser feitas usando SIFT, Polyphen2, LRT, MutationTaster e posteriormente anotadas com informações de dbSNP, COSMIC etc.
ChIP-Seq
Detecte picos usando PICS e MACS. Identifique locais de ligação de regulação de TF, genes afetados e sites de modificação de histonas. Descubra motivos significativos e os verifique contra JASPAR.
RNA-Seq pequena
Strand NGS suporta a quantificação de pequenas espécies de RNA incluindo miRNA, snRNA, snoRNA e scRNA. Ele também ajuda a identificar genes expressos diferencialmente e seus correspondentes alvos de mRNA.
Methyl-Seq
Strand NGS suporta detecção de metilação, análise de metilação diferencial em amostras / regiões-alvo e interpretação biológica na lista de genes afetados via GO, análise de caminhos etc.
Interpretação biológica
Strand NGS fornece suporte para análise de via, enriquecimento GO, GSEA, GSA e redes de interação derivadas de PNL.
Server Edition
A Server Edition fornece armazenamento centralizado, computação escalável e permite a análise colaborativa.
