SimMet

O banco de dados SimMet inclui 68.459 espécies de metabólitos de várias fontes biológicas, como seres humanos, E. coli. e suporta 2, 34284 MS/MS espectros com 354 adutos para 9.390 metabólitos de bancos de dados NIST MS/MS. Informações biológicas adicionais, como nome comum do metabólito, nome sistemático, massa, composição e links para as outras bases de dados, também são disponibilizadas para facilitar a referência.

SimMet oferece a identificação exata dos metabolitos combinando espectros observados de MS/MS de encontro aos espectros padrão de MS/MS dos metabolitos.

Suporte para vários formatos de arquivo

SimMet aceita dados de espectrometria de massas experimentais em formatos de arquivo padrão, como. txt,. xls,. mzData e. mzXML. Ele pode ler arquivos de dados nativos da Thermo Scientific (*.RAW) e SCIEX (*.WIFF) e da Bruker Corporation (.BAF, .Yep e .FID). O programa é capaz de importar dados de funcionamentos cromatográficos completos isto é até 200.000 varreduras.

• Robusto banco de dados relacional metabólito
• Suporte para vários formatos de arquivo
• Processamento de dados LC-MS e MS/MS
• Alta taxa de transferência MS e MS/MS análise de dados
• Metabolomics diferenciais para amostras biológicas
• Metabolomics quantitativos
• Anotação de espectros de massa com metabolito identificado